O gerenciador de arquivos do i3wm estava se comportando de forma estranha, em alguns programas em vez de abrir o thunar era aberto o Analisador de uso de discos ( Disk Usage Analyzer ) o problema era a configuração do xdg-open
Para solucionar o problema reconfigurei de forma correta
rodei o comando mimeopen -d para ele configurar qual aplicativo eu gostaria que fosse aberto o diretorio /home
$ mimeopen -d /home
escolhi a opção Thunar File Manager (thunar)
e aparentimente tudo se resolveu! todos os programas que podem abrir diretorios estão usando o thunar
OBS 1: Eu descobri que o problema era na configuração do xdg-open rodando o comando
$ xdg-open /home
e ele abria o Analisador de uso de discos ( Disk Usage Analyzer )
OBS 2:
você pode usar o comando mimeopen -d para configurar outras aplicações
ex:
$ mimeopen -d ~/arquivo.pdf
ele vai retornar programas que podem abrir pdfs para configurar como default
*** Outra solução (atualizado 2025) ***
1 - rode o comando
$ xdg-mime query default inode/directory
se mostrar org.gnome.baobab.desktop esse é o problema!
2 - solução, rode o comando
$ xdg-mime default thunar.desktop inode/directory
3 - rode o comando
$ xdg-mime query default inode/directory
se a saida for Thunar.desktop o problema foi resolvido!
4 - execute o comando xdg-open para verificar se tudo está resolvido
$ xdg-open /home
BONUS:
Também é possivel alterar de forma manual com o comando
$ vim ~/.config/mimeapps.list
E garantir que a seção [Default Applications] tenha:
inode/directory=Thunar.desktop